مطالعه محتوای پلاسمیدی جدایه های erwinia amylovora عامل بیماری سوختگی آتشی

در اکثر قریب به اتفاق جدایه های باکتری erwinia amylovora پلاسمید غیر قابل انتقال pea29 وجود دارد. علی رغم شباهت جدایه های این گونه، تفاوت در دامنه میزبانی و بیماری زایی در ارتباط با وجود پلاسمید و تنوع آن می باشد. تحقیق حاضر با هدف بررسی تنوع پلاسمیدی در جدایه های ایرانی عامل سوختگی آتشی، تکثیر قطعه psti از پلاسمید pea29 و هضم آنزیمی آن و بررسی وجود تعداد ردیف های تکراری کوتاه در جدایه های مربوط به میزبانهای مختلف و از مناطق مختلف جغرافیایی انجام گرفته است. با انجام آزمونهای فنوتیپی و بیماریزایی، از مجموع چهل و سه جدایه، 24 جدایه برای آزمون تشخیصی lfic، سنجش لوان سوکروز و مطالعات مولکولی انتخاب شدند. روش lfic قادر به ردیابیcfu/ml 106- 105 باکتری در عصاره گیاهی آلوده می باشد. همچنین ارتباطی بین میزان ترشح لوان سوکروز و شدت بیماریزایی جدایه ها مشخص نگردید. صحت وجود پلاسمید pea29 با استفاده از سه جفت آغازگر تشخیصی مرتبط بررسی گردید. آغازگرهای ea71(1)/ea71(2)، به عنوان دقیق ترین جفت در شناسایی جدایه های ea می باشند. ردیابی مولکولی سایر پلاسمیدهای ea با استفاده از 5 جفت آغازگر اختصاصی، حاکی از عدم تنوع پلاسمیدی در جدایه های ایران است. به غیر از pea29، جدایه های بدست آمده از زالزالک و به، حامل peu72 می باشند. هضم آنزیمی قطعه psti از پلاسمید pea29 جدایه های ایرانی توسط آنزیم برشی hpaii، جدایه های ایرانی را در چهار گروه قرار داد. چند شکلی مشاهده شده در طول قطعه بزرگتر و بین 360 تا 400 جفت باز متغیر است. جدایه های گروه 1 از منابع مختلف دانه دار و از استانهای مختلف ایران مربوط به سالهای مختلف در کنار جدایه استاندارد ea273 قرار گرفتند. گروه 2 در برگیرنده جدایه هایی از گلابی، به و زالزالک می باشد. جدایه های گروه 3 مربوط به استان لرستان و کمترین تعداد جدایه مربوط به گروه 4 بدست آمده از گیاه رز می باشند. بر اساس گروهبندی آنزیمی تعداد 15 جدایه برای تعیین توالی ناحیه psti انتخاب شدند. واحدهای تکراری به صورت attacaga در جدایه های ایران 4، 5، 7، و 8 بار تکرار می شوند. تمام جدایه های ea بدست آمده از سیب از مناطق جغرافیایی مختلف ایران دارای تعداد واحد تکراری 4 هستند که با نتایج حاصل از هضم آنزیمی مطابقت دارد. بر اساس داده های بررسی حاضر، شاخص تعداد واحدهای ssr، می تواند برای گروه بندی جدایه های ea استفاده شود و در بسیاری موارد ارتباط گروه بندی با منشاء جغرافیایی، نوع میزبان و سال جمع آوری مشاهده می گردد. ولی اطلاعات چندانی در رابطه با مبدا آلودگی و نحوه گسترش بیمارگر سوختگی آتشی در کشور بدست نمی آید.